行者于七住位证得阿赖耶识心体后，即能证得阿赖耶识之本来自性清净涅槃，其所得智慧称为本觉智，又称为根本无分别智。

所谓之“根本”，即谓阿赖耶识乃是五蕴之根本、出生五蕴之根本、五蕴空相之根本。因为阿赖耶识本身与所生之五阴十八界和合而呈现般若空，般若空即是五蕴空相之根本。

而所谓之“无分别”，即谓阿赖耶识出生六识觉知心，六识觉知心藉由五根触五尘现起而分别六尘境界，而六识心恒于六尘境界中见闻觉知，恒于六尘境界中分别了知；而阿赖耶识本身藉五根触五尘出生五识，藉意根触法尘出生意识，呈现内相分令六识心来分别，可自己却恒不与六尘相应，不于六尘中见闻觉知，亦即恒于六尘中如如不动。此第一种不分别。

第二种不分别，是谓阿赖耶识将其所含藏之五蕴十八界功能种子，按照业种内涵而变异成熟六道有情之五蕴身时，并不分别其所出生之六道五蕴身。阿赖耶识对此悉不分别，而是完全如实按照业种的涵而变异成熟。同时，阿赖耶识与所变异成熟之五蕴身于一起运作时，亦恒不分别五蕴身是我。

因为如是不分别，行者亲证此种不分别之实相境界，故称根本无分别；而行者证得阿赖耶识此种无分别之智慧，故称根本无分别智。

根本无分别智所证之物即谓阿赖耶识本身，而由意识具足分别心，亲证阿赖耶识后，分别阿赖耶识诸等法性。因此，乃是由意识证得阿赖耶识后，才能得此根本无分别智。

而根本无分别智并非谓意识心能于五尘不分别。因为意识心虽于五尘不分别，但仍然于定境法尘中了知、分别，因此意识心不于五尘分别时，并非无分别智。因为意识心之体性乃是永远分别，同时意识心能够分别所有诸法皆是缘起性空、缘生缘灭。

意识心因为能够观察一切法皆是缘生缘灭、缘起性空，因此不去分别诸法，而一律以缘起性空等视之。然此智慧并非无分别，因为纵然所有诸法皆是缘生缘灭，皆是缘起性空，但意识心仍然以其分别之体性分别一切法缘生缘灭、缘起性空，因此意识心能证得一切法皆是缘起性空而不分别，不贪爱、不厌离，如是并不表示意识心具备无分别智慧。因为意识心仍然是以其能分别之体性分别一切法缘起性空。

因此，根本无分别智并非是谓意识心于五尘不分别，或谓意识心因为了知一切法缘生缘灭后，而于一切法不分别取舍，而是有一本不分别之心能生万法，此即法界实相，其被能分别之意识心证得，现见如来藏本不分别，因此生起法界实相智慧，此称证得无分别智。

根本无分别智即是本觉智，而根本无分别智又称总相智，亦即行者证得阿赖耶识后，于阿赖耶识与五蕴运行之相貌必然了知。亦即是说，证得阿赖耶识者，必然能了知阿赖耶识于五尘中、六尘中如如不动之不分别为何；必定能了知己身之阿赖耶识、众生有情身之阿赖耶识，仍以如此不分别方式成就六道有情之异熟果报。此即行者首个必定能得之智慧，故称总相智。